Το βασικό θεσμικό πλαίσιο, που διέπει τη διαχείριση της εξωτερικής χρηματοδότησης της έρευνας στα Πανεπιστήμια, συνίσταται - κατά χρονολογική σειρά - από τα παρακάτω:
- Το Προεδρικό Διάταγμα 432/81 «Περί συστάσεως Ειδικών Λογαριασμών αξιοποιήσεως κονδυλίων για την εκτέλεση ερευνητικών έργων στα Α.Ε.Ι. της χώρας».
- Το Νόμο 1514/85 «Ανάπτυξη της επιστημονικής και τεχνολογικής έρευνας».
- Την Υπουργική Απόφαση Β1/819/88 «Σύσταση Ειδικών Λογαριασμών για τη χρηματοδότηση ερευνητικών έργων και σχετικών υπηρεσιών ή δραστηριοτήτων που εκτελούνται στα Α.Ε.Ι. ή Τ.Ε.Ι. της Χώρας».
- Την Κοινή Υπουργική Απόφαση ΚΑ/679/22-08-96 «Τροποποίηση και αντικατάσταση της Υπουργικής Απόφασης Β1/819/88».
- Το Νόμο 3027/2002, άρθρο 3, παράγραφος 2 «Σύνταξη Οδηγού Χρηματοδότησης και Διαχείρισης του Ειδικού Λογαριασμού».
- Το Φ.Ε.Κ. 416/9-3-2009 «Έγκριση του Οδηγού Χρηματοδότησης και διαχείρισης του Ειδικού Λογαριασμού του Δ.Π.Θ.».
- Το Νόμο 3494/4-9-2009/Φ.Ε.Κ. 156, άρθρο 36 «Κύρωση της υπ’ αριθμ. 679/1996 κοινής υπουργικής απόφασης (Φ.Ε.Κ. 826 Β΄)».
- Την 4763/23-2-2010 Απόφαση της Συγκλήτου «Τροποποίηση άρθρου 5.1 του Οδηγού Χρηματοδότησης του Ε.Λ./Δ.Π.Θ.»
- Το Νόμο 3848/19-5-2010/Φ.Ε.Κ. 71, άρθρα 36 και 37, παράγραφος 6 «Θέματα των Ειδικών Λογαριασμών Κονδυλίων Έρευνας των Α.Ε.Ι.».